בית החינוך אמי”ת חצור הגלילית הוקם בשנת תשנ”ה כשמחזור א החל את כיתה ז.
הרוח החייה בהקמת בית החינוך היה המנהל המיתולוגי יוסי ברנס שעמד במשך שנים ארוכות בראש בית הספר היסודי “חוני המעגל” ושאף למסגרת המשך עבור התלמידים בחינוך הדתי. יוסי אף היה המנהל בשנים הראשונות של התיכון.
עם הקמת בית החינוך החל לפעול בתחומו גרעין תורני של בוגרי ישיבות הסדר שהמשיכו את לימודם ב”כולל” בלימוד הסמכה לרבנות. האברכים היו לומדים מדי יום עם התלמידים בבקר ואחר הצהרים והיו משמעותיים מאד לתלמידים הן מבחינה לימודית והן מבחינה ערכית. במשך השנים הכולל נסגר והאברכים השתלבו בעבודת החינוך בבית החינוך, ועד היום חלקם דמויות משמעותיו בתחום החינוך בחצור ומחוצה לה.
בית החינוך מחולק לנתיב בנים ונתיב בנות ומקבל תלמידים מחצור הגלילית ומישובי הסביבה.
בית החינוך שואף להצמיח תלמידים מחוברים לתורה והמצוות ומסורת ישראל מצוינים במדעים וכל תחומי הידע ומחוברים לחברה והמדינה.
את בוגרי בית החינוך אפשר למצוא בצמתים שונים בחברה הישראלית, למשל – קציני צבא ומשטרה אנשי חינוך ותלמידי חכמים.
כיום מנהל את בית החינוךבוגר מחזור ב’, בעז יוספי, שמתגורר עם משפחתו בחצור הגלילית.